生物显微镜是用来观察生物切片、生物细胞、细菌以及活体组织培养、流质沉淀等的观察和研究，同时可以观察其他透明或者半透明物体以及粉末、细小颗粒等物体。左图所示为生产的倒置生物显微镜型，该生物显微镜也是食品厂、饮用水厂办QS、HACCP认证的必备检验设备。生物显微镜供医疗卫生单位、高等院校、研究所用于微生物、细胞、细菌、组织培养、悬浮体、沉淀物等的观察，可连续观察细胞、细菌等在培养液中繁殖分裂的过程等。在细胞学、寄生虫学、肿瘤学、免疫学、遗传工程学、工业微生物学、植物学等领域中应用广泛。

在生命科学领域，随着科研水平和实验手段不断的提高，荧光染色方法以其特异性强，使用相对于放射性元素更安全，检测越来越灵敏等特点，受到越来越多的研究人员的认可，并且在实验室中广泛应用，成为经常性的实验方法。

检测荧光方法和手段根据不同的实验要求和目的也多种多样，使用zui多的还是荧光显微镜，荧光酶标仪，流式细胞仪等。但是，无论何种仪器，无论仪器的性能如何，要得到准确的实验结果，准确的实验数据，zui基本的条件就是根据所使用的荧光染料正确设置激发和发射波长。